药物流产给身体带来的伤害绝不比人工流产手术小。因为它通过影响内分泌来达到迫使子宫内膜强行脱落的目的，在损伤子宫内膜的同时，还有扰乱内分泌平衡的危险，这些都会引起早期流产或胎儿畸形及胎停育甚至闭经等。已证明，许多病原体如L-B双球菌、砂眼衣原体、脲素分解支原体等都可以引起女性的宫颈管炎、上行导致输卵管炎、子宫内膜炎和盆腔炎等。女性的这些感染往往是临床症状不明显，但病变渐进而隐蔽，最终导致不孕或宫外孕。
　　
　　药物流产的副作用最小的也容易引起月经失调，表现为月经周期缩短或延长，月经量增多。而对于未生育的妇女来说，如果反復使用，不仅容易引起感染或大出血，还有可能导致不孕，造成终身遗憾。
　　
　　其实，不管手术刮宫还是药物流产，除了对肉体上的损伤外，其引起的激素变化对人体的伤害也是难以察觉的。肉体上的损伤很快就可以修復，但内分泌变化对人体的打击却不是一天两天就能恢復过来的。瓜熟蒂落的分娩，是按一定规律进行的，机体对此有充足的适应与准备时间，而人為的中断怀孕，机体由于内分泌功能突然急骤下降，没有一个缓慢的适应过程，这对人体的打才是最大的。
　　
　　而且，由于药物流产会留下一定的并发症，因此，目前医学上规定，药物流产只能在具有一定设备的医疗保健机构中使用，以便在出血多或出血时间较长的情况下进行手术刮宫，以及抗感染，输液和输血治疗。所以，千万不要在家用随意滥用，应该由有经验的妇产科医生根据具体情况来决定。