诊断的主要方法：
　　
　　1.病史询问的重点是月经史、孕产史、家族史及手术史。特别注意疼痛或痛经的发生发展与月经和剖宫产、人流术、输卵管通液术等手术的关系。
　　
　　2.妇科检查除双合诊检查外，应特别强调必须进行三合诊检查。盆腔子宫内膜异位症时子宫多为后位，活动度不良或固定；宫骶韧带和后穹隆有触痛性结节为特征性的体征；卵巢子宫内膜异位症者，在附件区可触及与子宫或阔韧带、盆壁相粘连囊性肿块，活动度差，往往有轻度触痛，囊肿一般小于10cm。
　　
　　3.腹腔镜检查是目前国际公认的内异症诊断的最佳方法。在腹腔镜下见到大体病理所述典型病灶，诊断可基本成立，术中所见亦是临床分期的重要依据。特别是轻、中度子宫内膜异位症、可疑内异症造成的不孕和慢性盆腔痛、妇科检查有盆腔触痛性结节，而B型超声检查又无阳性发现的患者，有条件的应将腹腔镜作为首选确诊方法。腹腔镜也是治疗子宫内膜异位症最常用的方法。
　　
　　诊断的辅助方法：
　　
　　通常病患怀疑子宫内膜异位症寻求医师检查时，不同的医师会有不同的解释而让病患感到茫然。所以如何确立诊断，以腹腔镜及病理切片最为准确，有几种方法可以做为辅助供医师做参考的检查。
　　
　　（1）超音波检查：为一种不具侵袭性的检查，0.5公分以上的肿瘤都可有效检验出来。但是对于子宫内膜异位瘤除外，在骨盆腔上面的子宫内膜异位症的分布，无法使用超音波检查。
　　
　　（2）CA-125：是种细胞表面的抗原，怀孕、肝脏疾病、月经来潮及子宫内膜异位症通常CA-125浓度会上升，但是，有严重子宫内膜异位症的患者，CA-125的指数是正常。所以CA-125只能做为子宫内膜异位症的参考及复发的指标，无法确立诊断。
　　
　　（3）腹腔镜：是种手术，用来做骨盆腔及腹腔的直接观察，确定病灶的大小，侵犯的地方、沾黏的位置及程度。不过子宫内膜异位症的外观上有很大的变化，像是有巧克力或暗铁锈色的液体或是暗红色纤维化等，需要有经验的医师才有办法正确诊断。
　　
　　腹腔镜检查的同时，若发现有病灶也可一起治疗。经过腹腔镜的检查后，医师可根据所见的将子宫内膜异位症分为四个等级<美国生殖医学会的分级标准>。因子宫内膜异位症的严重度及治疗的效果，都与复发性有相关性。它的标准是依据点数区分：
　　
　　（1）1-5点，极轻度子宫内膜异位症。
　　
　　（2）6-15点，轻度子宫内膜异位症。
　　
　　（3）16-40点，中度子宫内膜异位症。
　　
　　（4）40点以上，重度子宫内膜异位症。
　　
　　第1-2级子宫内膜异位症可能只有在腹腔或骨盆腔处，子宫后穹隆或卵巢表面有病灶出现。第3-4级子宫内膜异位症会有子宫内膜异位瘤，重度的沾黏甚至子宫后穹隆完全阻塞。因此做完整的腹腔镜治疗是十分重要的，有正确的分级，才有正确的手术及决定术后的治疗方针。
　　
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